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课题组长

李燕

姓 名 李燕 性 别 职 称 研究员
学 历 博士 电 话 传 真
电子邮件 liy@simm.ac.cn 个人主页 主页链接 专家类别
职 务 课题组长
通讯地址 烟台市牟平区滨海东路198号
个人简介
李燕,中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院研究员,课题组长。2018年6月于中国科学院分子细胞科学卓越创新中心获得博士学位;2018年6月到2020年9月在中国科学院分子细胞科学卓越创新中心从事博士后研究;2020年9月到2023年2月,任中国科学院分子细胞科学卓越创新中心副研究员;2023年3月全职加入中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院。
长期从事遗传谱系示踪相关的研究工作,前期参与创建了基于Cre-LoxP和Dre-Rox的双同源重组谱系示踪技术,利用该技术解决了哺乳动物成体心脏心肌细胞来源这一重要科学问题(Li et al., Circulation, 2018);受邀撰写综述文章,系统阐述了遗传谱系示踪技术在心血管领域的应用(Li et al., Nat Rev Cardiol, 2018);揭示了胚胎发育过程中和新生期心脏非心肌细胞向心肌细胞转换的精确过程和调控机制(Li et al., Circ Res, 2019);拓展了双同源重组谱系示踪技术的应用范围,创建诱导型无缝隙遗传谱系示踪技术,利用该技术揭示了乳腺肿瘤转移中上皮细胞向间充质细胞的转换存在异质性(Li et al., Dev Cell, 2020)。

教育经历:
2013.09-2018.06 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,生物化学与分子生物学,博士
2009.09-2013.06 山东师范大学生命科学学院,生物科学,学士


工作经历
      2023.03-至今,中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院,
      研究员、课题组长
      2020.09-2023.02 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心, 副研究员
      2018.06-2020.09 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心, 博士后


     
     
     
     
研究方向

1. 建立并发展示踪体内增殖细胞的技术——ProTracer (Proliferation Tracer) 技术。

2. 以ProTracer技术作为动物体内筛选平台,筛选体内促进细胞增殖的候选药物,实现器官原位再生。

3. 器官发育和损伤修复过程中细胞命运可塑性研究。

科研项目
科研成果

长期致力于双同源重组酶谱系示踪技术的开发和应用,整合遗传学,细胞生物学,再生医学和生物信息学,以小鼠为主要模式生物,在探讨哺乳动物心脏心肌细胞来源,肿瘤细胞转移过程中上皮细胞向间充质细胞转换等领域开展了一系列研究,并主要取得了以下研究成果:

1. 揭示了哺乳动物成体心脏心肌细胞的主要来源问题。

2. 揭示了胚胎期及新生期心脏非心肌细胞向心肌细胞转换的精确过程。

3. 揭示了乳腺肿瘤细胞转移中上皮细胞向间充质细胞的转换存在异质性。


荣誉获奖

    2018年度 中国科学院大学院长优秀奖学金

    2019年度 和也博士后奖励基金

    2019年度 赛诺菲-优秀在站博士后奖励基金

    2019年度 中科院分子细胞科学卓越创新中心博士后奖励

    2021年度 赛诺菲-优秀青年科技人才奖励基金

代表论著

    第一作者或共同第一作者:

    1. Li Yan#, Lv Zan#, Zhang Shaohua, Wang Zhuo, He Lingjuan, Tang Muxue, Pu Wenjuan, Zhao Huan, Zhang Zhenqian, Shi Qihui, Cai Dongqing, Wu Mingfu, Hu Guohong, Lui Kathy O, Feng Jing,Nieto M. Angela, Zhou Bin*. Genetic Fate Mapping of Transient Cell Fate Reveals N-Cadherin Activity and Function in Tumor Metastasis. Dev Cell. 2020; 54(5):593-607. (Featured Article) 

    2. Li Yan#, Lv Zan, He Lingjuan, Huang Xiuzhen, Zhang Shaohua, Zhao Huan, Pu Wenjuan, Li Yi, Yu Wei, Zhang Libo, Liu Xiuxiu, Liu Kuo, Tang Juan, Tian Xueying, Wang Qing-dong, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic Tracing Identifies Early Segregation of the Cardiomyocyte and Non-myocyte Lineages. Circ Res. 2019; 125(3): 343-355. (Cover story)

    3. Li Yan#, He Lingjuan#, Huang Xiuzhen, Issa Bhaloo S, Zhao Huan, Zhang Shaohua, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Li Yi, Liu Qiaozhen, Yu Wei, Zhang Libo, Liu Xiuxiu, Liu Kuo, Tang Juan, Zhang Hui, Cai Dongqing, Adams RH, Xu Qingbo, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic Lineage Tracing of Non-Myocyte Population by Dual Recombinases. Circulation. 2018;138:793–805. 

    4. Li Yan#, Lui Kathy O*, Zhou Bin*, Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in cardiovascular diseases. Nat Rev Cardiol. 2018; 15:445-456.

    5. Li Yan#, Tian Xueying, Zhao Huan, He Lingjuan, Zhang Shaohua, Huang Xiuzhen, Zhang Hui, Miquerol Lucile, Zhou Bin*. Genetic targeting of Purkinje fibres by Sema3a-CreERT2. Sci Rep. 2018; 8:2382. 

    共同作者:

    1. He Lingjuan#, Li Yan, Li Yi, Pu Wenjuan, Huang Xiuzhen, Tian Xueying, Wang Yue, Zhang Hui, Liu Qiaozhen, Zhang Libo, Zhao Huan, Tang Juan, Ji Hongbin, Cai Dongqing, Han Zhibo, Han Zhongchao, Nie Yu, Hu Shengshou, Wang Qingdong, Sun Ruilin, Fei Jian, Wang Fengchao, Chen Ting, Yan Yan, Huang Hefeng, Pu William T, Zhou Bin*. Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases. Nat Med. 2017; 23:1488-1498. 8(1): 2382.

    2. Zhang Shaohua#, Li Yan, Huang Xiuzhen, Liu Kuo, Wang Qingdong, Chen Aizhong, Sun Kai, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Seamless Genetic Recording of Transiently Activated Mesenchymal Gene Expression in Endothelial Cells During Cardiac Fibrosis. Circulation. 2021; 144:2004-2020.

    3. Zhao Huan#, Li Yan, He Lingjuan, Pu Wenjuan, Yu Wei, Li Yi, Wu Yanting, Xu Chengming, Wei Yuda, Ding Qiurong, Song Baoliang, Huang Hefeng*, Zhou Bin*. In Vivo AAV-CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing Ameliorates Atherosclerosis in Familial Hypercholesterolemia. Circulation. 2020;141:67–79.

    4. Tang Juan#, Li Yan, Huang Xiuzhen, He Lingjuan, Zhang Libo, Wang Haixiao, Yu Wei, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Nie Yu, Hu Shengshou, Wang Qingdonh, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Fate Mapping of Sca1+ Cardiac Progenitor Cells in the Adult Mouse Heart. Circulation. 2018;138:2967-2969.

    5. He Lingjuan#, Li Yan, Huang Xiuzhen, Li Yi, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Cai Dongqing, Huang Hefeng, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic lineage tracing of resident stem cells by DeaLT. Nat Protoc. 2018; 13(10): 2217-2246.

    6. Tian Xueying#, Li Yan, He Lingjuan, Zhang Hui, Huang Xiuzhen, Liu Q,iaozhen Pu Wenjuan, Zhang Libo, Li Yi, Zhao Huan, Wang Zhifu, Zhu Jianhong, Nie Yu, Hu Shenshou, Sedmera David, Zhong TaoP, Yu Ying, Zhang Li, Yan Yan, Qiao Zengyong, Wang Qing-Dong, Wu Sean M, Pu William T, Anderson Robert H, Zhou Bin*. Identification of a hybrid myocardial zone in the mammalian heart after birth. Nat Commun. 2017; 8(1): 87.

    7. He Lingjuan#, Pu Wenjuan#, Liu Xiuxiu#, Zhang Zhenqian, Han Maoying, Li Yi, Huang Xiuzhen, Han Ximeng, Li Yan, Liu Kuo, Shi Mengyang, Lai Liang, Sun Ruilin, Wang Qing-Dong, Ji Yong, Tchorz Jan S, Zhou Bin*. Proliferation tracing reveals regional hepatocyte generation in liver homeostasis and repair. Science. 2021; 371(6532): eabc4346.

    8. Han Xinmeng#, Zhang Zhenqian#, He Lingjuan#, Zhu Huan#, Li Yan, Pu Wenjuan, Han Maoying, Zhao Huan, Liu Kuo, Li Yi, Huang Xiuzhen, Zhang Mingjun, Jin Hengwei, Lv Zan, Tang Juan, Wang Jinjin, Sun Ruilin, Fei Jian, Tian Xueying, Duan Shenzhong, Wang Qing-Dong, Wang Lixin, He Ben, Zhou Bin*. A Suite of New Dre-recombinase Drivers Markedly Expands the Ability to Perform Intersectional Genetic Targeting. Cell Stem Cell. 2021; 2021; 28: 1–17.

    9. Liu Xiuxiu#, Pu Wenjuan#, He Lingjuan#, Li Yan, Zhao Huan, Li Yi, Liu Kuo, Huang Xiuzhen, Weng Wendong, Wang Qing-Dong, Shen Linghong, Zhong Tao, Sun Kun, Ardehali Reza, He Ben*, Zhou Bin*. Cell proliferation fate mapping reveals regional cardiomyocyte cell-cycle activity in subendocardial muscle of left ventricle. Nat Commun. 2021 Oct 1;12(1):5784.

    10. Tang Juan#, Wang Haixiao# Huang Xiuzhen#, Li Fei#, Zhu Huan, Li Yan, He Lingjuan, Zhang Hui, Pu Wenjuan, Liu Kuo, Zhao Huan, Bentzon Jacob Fog, Yu Ying, Ji Yong, Nie Yu, Tian Xueying, Zhang Li, Gao Dong, Zhou Bin*. Arterial Sca1+ vascular stem cells generate de novo smooth muscle for artery repair and regeneration. Cell Stem Cell. 2020; 2020;141:67–79.

    11. Zhao Huan#, Tian Xueying, He Lingjuan, Li Yan, Pu Wenjuan, Liu Qiaozhen, Tang Juan, Wu Jiaying, Cheng Xin, Liu Yang, Zhou Qingtong, Tan Zhen, Bai Fan, Xu Fei, Smart Nicola, Zhou Bin*. Apj+ vessels drive tumor growth and represent a tractable therapeutic target. Cell Rep. 2018;25:1241-1254.e5.

    12. Zhang Hui#, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Huang Xiuzhen, He Lingjuan, Liu Qiaozhen, Li Yan, Zhang Libo, He Liang, Liu Kuo, Gillich Astrid, Zhou Bin*. Genetic lineage tracing identifies endocardial origin of liver vasculature. Nat Genet. 2016; 48(5):537-543.


社会任职

李燕

姓 名 李燕 性 别 职 称 研究员
学 历 博士 电 话 传 真
电子邮件 liy@simm.ac.cn 个人主页 主页链接 专家类别
职 务 课题组长
通讯地址 烟台市牟平区滨海东路198号
个人简介
    李燕,中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院研究员,课题组长。2018年6月于中国科学院分子细胞科学卓越创新中心获得博士学位;2018年6月到2020年9月在中国科学院分子细胞科学卓越创新中心从事博士后研究;2020年9月到2023年2月,任中国科学院分子细胞科学卓越创新中心副研究员;2023年3月全职加入中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院。
    长期从事遗传谱系示踪相关的研究工作,前期参与创建了基于Cre-LoxP和Dre-Rox的双同源重组谱系示踪技术,利用该技术解决了哺乳动物成体心脏心肌细胞来源这一重要科学问题(Li et al., Circulation, 2018);受邀撰写综述文章,系统阐述了遗传谱系示踪技术在心血管领域的应用(Li et al., Nat Rev Cardiol, 2018);揭示了胚胎发育过程中和新生期心脏非心肌细胞向心肌细胞转换的精确过程和调控机制(Li et al., Circ Res, 2019);拓展了双同源重组谱系示踪技术的应用范围,创建诱导型无缝隙遗传谱系示踪技术,利用该技术揭示了乳腺肿瘤转移中上皮细胞向间充质细胞的转换存在异质性(Li et al., Dev Cell, 2020)。

    教育经历:
    2013.09-2018.06 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,生物化学与分子生物学,博士
    2009.09-2013.06 山东师范大学生命科学学院,生物科学,学士


工作经历
      2023.03-至今,中国科学院上海药物研究所/中科环渤海(烟台)药物高等研究院,
      研究员、课题组长
      2020.09-2023.02 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心, 副研究员
      2018.06-2020.09 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心, 博士后


     
     
     
     
研究方向

    1. 建立并发展示踪体内增殖细胞的技术——ProTracer (Proliferation Tracer) 技术。

    2. 以ProTracer技术作为动物体内筛选平台,筛选体内促进细胞增殖的候选药物,实现器官原位再生。

    3. 器官发育和损伤修复过程中细胞命运可塑性研究。

科研项目
科研成果

    长期致力于双同源重组酶谱系示踪技术的开发和应用,整合遗传学,细胞生物学,再生医学和生物信息学,以小鼠为主要模式生物,在探讨哺乳动物心脏心肌细胞来源,肿瘤细胞转移过程中上皮细胞向间充质细胞转换等领域开展了一系列研究,并主要取得了以下研究成果:

    1. 揭示了哺乳动物成体心脏心肌细胞的主要来源问题。

    2. 揭示了胚胎期及新生期心脏非心肌细胞向心肌细胞转换的精确过程。

    3. 揭示了乳腺肿瘤细胞转移中上皮细胞向间充质细胞的转换存在异质性。


荣誉获奖

    2018年度 中国科学院大学院长优秀奖学金

    2019年度 和也博士后奖励基金

    2019年度 赛诺菲-优秀在站博士后奖励基金

    2019年度 中科院分子细胞科学卓越创新中心博士后奖励

    2021年度 赛诺菲-优秀青年科技人才奖励基金

代表论著

    第一作者或共同第一作者:

    1. Li Yan#, Lv Zan#, Zhang Shaohua, Wang Zhuo, He Lingjuan, Tang Muxue, Pu Wenjuan, Zhao Huan, Zhang Zhenqian, Shi Qihui, Cai Dongqing, Wu Mingfu, Hu Guohong, Lui Kathy O, Feng Jing,Nieto M. Angela, Zhou Bin*. Genetic Fate Mapping of Transient Cell Fate Reveals N-Cadherin Activity and Function in Tumor Metastasis. Dev Cell. 2020; 54(5):593-607. (Featured Article) 

    2. Li Yan#, Lv Zan, He Lingjuan, Huang Xiuzhen, Zhang Shaohua, Zhao Huan, Pu Wenjuan, Li Yi, Yu Wei, Zhang Libo, Liu Xiuxiu, Liu Kuo, Tang Juan, Tian Xueying, Wang Qing-dong, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic Tracing Identifies Early Segregation of the Cardiomyocyte and Non-myocyte Lineages. Circ Res. 2019; 125(3): 343-355. (Cover story)

    3. Li Yan#, He Lingjuan#, Huang Xiuzhen, Issa Bhaloo S, Zhao Huan, Zhang Shaohua, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Li Yi, Liu Qiaozhen, Yu Wei, Zhang Libo, Liu Xiuxiu, Liu Kuo, Tang Juan, Zhang Hui, Cai Dongqing, Adams RH, Xu Qingbo, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic Lineage Tracing of Non-Myocyte Population by Dual Recombinases. Circulation. 2018;138:793–805. 

    4. Li Yan#, Lui Kathy O*, Zhou Bin*, Reassessing endothelial-to-mesenchymal transition in cardiovascular diseases. Nat Rev Cardiol. 2018; 15:445-456.

    5. Li Yan#, Tian Xueying, Zhao Huan, He Lingjuan, Zhang Shaohua, Huang Xiuzhen, Zhang Hui, Miquerol Lucile, Zhou Bin*. Genetic targeting of Purkinje fibres by Sema3a-CreERT2. Sci Rep. 2018; 8:2382. 

    共同作者:

    1. He Lingjuan#, Li Yan, Li Yi, Pu Wenjuan, Huang Xiuzhen, Tian Xueying, Wang Yue, Zhang Hui, Liu Qiaozhen, Zhang Libo, Zhao Huan, Tang Juan, Ji Hongbin, Cai Dongqing, Han Zhibo, Han Zhongchao, Nie Yu, Hu Shengshou, Wang Qingdong, Sun Ruilin, Fei Jian, Wang Fengchao, Chen Ting, Yan Yan, Huang Hefeng, Pu William T, Zhou Bin*. Enhancing the precision of genetic lineage tracing using dual recombinases. Nat Med. 2017; 23:1488-1498. 8(1): 2382.

    2. Zhang Shaohua#, Li Yan, Huang Xiuzhen, Liu Kuo, Wang Qingdong, Chen Aizhong, Sun Kai, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Seamless Genetic Recording of Transiently Activated Mesenchymal Gene Expression in Endothelial Cells During Cardiac Fibrosis. Circulation. 2021; 144:2004-2020.

    3. Zhao Huan#, Li Yan, He Lingjuan, Pu Wenjuan, Yu Wei, Li Yi, Wu Yanting, Xu Chengming, Wei Yuda, Ding Qiurong, Song Baoliang, Huang Hefeng*, Zhou Bin*. In Vivo AAV-CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing Ameliorates Atherosclerosis in Familial Hypercholesterolemia. Circulation. 2020;141:67–79.

    4. Tang Juan#, Li Yan, Huang Xiuzhen, He Lingjuan, Zhang Libo, Wang Haixiao, Yu Wei, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Nie Yu, Hu Shengshou, Wang Qingdonh, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Fate Mapping of Sca1+ Cardiac Progenitor Cells in the Adult Mouse Heart. Circulation. 2018;138:2967-2969.

    5. He Lingjuan#, Li Yan, Huang Xiuzhen, Li Yi, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Cai Dongqing, Huang Hefeng, Lui Kathy O, Zhou Bin*. Genetic lineage tracing of resident stem cells by DeaLT. Nat Protoc. 2018; 13(10): 2217-2246.

    6. Tian Xueying#, Li Yan, He Lingjuan, Zhang Hui, Huang Xiuzhen, Liu Q,iaozhen Pu Wenjuan, Zhang Libo, Li Yi, Zhao Huan, Wang Zhifu, Zhu Jianhong, Nie Yu, Hu Shenshou, Sedmera David, Zhong TaoP, Yu Ying, Zhang Li, Yan Yan, Qiao Zengyong, Wang Qing-Dong, Wu Sean M, Pu William T, Anderson Robert H, Zhou Bin*. Identification of a hybrid myocardial zone in the mammalian heart after birth. Nat Commun. 2017; 8(1): 87.

    7. He Lingjuan#, Pu Wenjuan#, Liu Xiuxiu#, Zhang Zhenqian, Han Maoying, Li Yi, Huang Xiuzhen, Han Ximeng, Li Yan, Liu Kuo, Shi Mengyang, Lai Liang, Sun Ruilin, Wang Qing-Dong, Ji Yong, Tchorz Jan S, Zhou Bin*. Proliferation tracing reveals regional hepatocyte generation in liver homeostasis and repair. Science. 2021; 371(6532): eabc4346.

    8. Han Xinmeng#, Zhang Zhenqian#, He Lingjuan#, Zhu Huan#, Li Yan, Pu Wenjuan, Han Maoying, Zhao Huan, Liu Kuo, Li Yi, Huang Xiuzhen, Zhang Mingjun, Jin Hengwei, Lv Zan, Tang Juan, Wang Jinjin, Sun Ruilin, Fei Jian, Tian Xueying, Duan Shenzhong, Wang Qing-Dong, Wang Lixin, He Ben, Zhou Bin*. A Suite of New Dre-recombinase Drivers Markedly Expands the Ability to Perform Intersectional Genetic Targeting. Cell Stem Cell. 2021; 2021; 28: 1–17.

    9. Liu Xiuxiu#, Pu Wenjuan#, He Lingjuan#, Li Yan, Zhao Huan, Li Yi, Liu Kuo, Huang Xiuzhen, Weng Wendong, Wang Qing-Dong, Shen Linghong, Zhong Tao, Sun Kun, Ardehali Reza, He Ben*, Zhou Bin*. Cell proliferation fate mapping reveals regional cardiomyocyte cell-cycle activity in subendocardial muscle of left ventricle. Nat Commun. 2021 Oct 1;12(1):5784.

    10. Tang Juan#, Wang Haixiao# Huang Xiuzhen#, Li Fei#, Zhu Huan, Li Yan, He Lingjuan, Zhang Hui, Pu Wenjuan, Liu Kuo, Zhao Huan, Bentzon Jacob Fog, Yu Ying, Ji Yong, Nie Yu, Tian Xueying, Zhang Li, Gao Dong, Zhou Bin*. Arterial Sca1+ vascular stem cells generate de novo smooth muscle for artery repair and regeneration. Cell Stem Cell. 2020; 2020;141:67–79.

    11. Zhao Huan#, Tian Xueying, He Lingjuan, Li Yan, Pu Wenjuan, Liu Qiaozhen, Tang Juan, Wu Jiaying, Cheng Xin, Liu Yang, Zhou Qingtong, Tan Zhen, Bai Fan, Xu Fei, Smart Nicola, Zhou Bin*. Apj+ vessels drive tumor growth and represent a tractable therapeutic target. Cell Rep. 2018;25:1241-1254.e5.

    12. Zhang Hui#, Pu Wenjuan, Tian Xueying, Huang Xiuzhen, He Lingjuan, Liu Qiaozhen, Li Yan, Zhang Libo, He Liang, Liu Kuo, Gillich Astrid, Zhou Bin*. Genetic lineage tracing identifies endocardial origin of liver vasculature. Nat Genet. 2016; 48(5):537-543.


社会任职